鉴于预应力混凝土施工技术特点及其结构，由于预应力混凝土施工技术存在起步晚，应用面广等特点，在进行民用建筑施工过程中，会出现相关预应力工程施工难点。
1.地板层无粘结预应力板筋
在预应力混凝土施工过程中，由于底层板间筋体量大且间距较小，对承载力荷载要求过大，及其质量要求普遍较高，一般板间单位面积所使用的预应力钢筋量多大26根，承载基础底板的最厚处达1200mm，因此在施工中预应力钢筋与底层板施工顺序，各支撑点的锚固段安装和预应力线性控制等的控制皆为施工过程中的难点；另外预应力筋在多跨度底板中的支撑控制和线性控制等均为施工技术的难点所在。
2.有粘结预应力板筋
在梁板柱的梁柱节点处，钢筋配备和相关预应力位置在放置顺序和放置位置选择时，均较为复杂，如若出现位置放置不当或相关粘结性预应力失位情况，会给整体建筑结构承载力出现影响。此外，在内部结构预应力配置中，由于部分核心梁板柱，承载力柱中多数配置型刚，因此钢筋，预应力波纹管等材料在施工过程中的位置摆设也会造成相互干扰等情况，也是施工阶段的工程难点。
最后在预应力张拉端处，由于锚具体积较大，因此可能出现无法放置柱中情形，而采用外锚形式则会使封锚也成为预应力混凝土施工中的难点之一。